Spider-Man – Hämähäkkimies on sarjakuvahahmoon perustuva elokuva pojasta, joka saa supervoimat hämähäkin puremasta. Tätinsä ja setänsä luona asuva, orvoksi jäänyt Peter Parker (Tobey Maquire) on lukiolainen ja koulukiusattu nörtti, joka on lapsesta asti ollut ihastunut naapurin Mary Janeen (Kirsten Dunst), mutta tämä ei huomaa häntä. Peterin parhaan ystävän isä (Willem Dafoe) on tiedemies, joka kehittelee erilaisia laitteita ja aineita laboratoriossaan. Kun mies päättää testata niitä itseensä, hänen persoonansa jakautuu kahtia ja toisesta puoliskosta tulee Spider-Manin vihollinen, Vihreä Menninkäinen.